计算小白硬学VASP系列——《Learn VASP from pymatgen》章节目录

《Learn VASP from pymatgen》汇总

1、前期准备

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• 编译pymatgen，配置相关环境

2、学会使用Materials Project

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• 介绍无机结构网站Materials Project下载结构、获取已有性质
• 介绍mp_api接口的用法

3、MPRelaxSet用法

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• 了解最常用的结构优化模块MPRelaxSet()使用
• 自定义参数设置（INCAR tags，K点个数）

4、态密度计算输入自动生成

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• MPRelaxSet()、MPstaticSet()、MPNonSCFSet()配合使用生成dos计算输入

5、态密度结果分析

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• 提起总态密度TDOS
• 提取分态密度PDOS

6、态密度结果绘图

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• Matplotlib库绘图
• Dosplotter()模块绘图
• 如何平滑处理态密度图，减少毛刺

7、能带计算

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• HighSymmKpath()方法自动生成高对称路径

8、能带分析

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• BandStructure()方法提取能带信息
• BSPlotter()方法自动绘图

9、能带态密度汇总

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• BSDOSPlotter()方法同时绘制能带态密度结果

10、构建slab模型

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• SlabGenerator模块自动生成slab结构

11、构建异质结模型

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• CoherentInterfaceBuilder & ZSLGenerator生成异质结结构

12、自动搜索吸附位点&构建吸附模型

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• AdsorbateSiteFinder搜索吸附位点
• 吸附模型2D可视化
• 调用ase导入常见吸附分子

13、Transformation类用法（一）

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• AutoOxiStateDecorationTransformation
• ChargedCellTransformation

14、Transformation类用法（二）

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• SubstitutionTransformation
• ReplaceSiteSpeciesTransformation

15、Transformation类用法（三）

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• OrderDisorderedStructureTransformation

To be continued